收到 TimeoutException 的可能原因是啥:使用 Spark 时,期货在 [n 秒] 后超时 [重复]

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【中文标题】收到 TimeoutException 的可能原因是啥:使用 Spark 时,期货在 [n 秒] 后超时 [重复]【英文标题】:What are possible reasons for receiving TimeoutException: Futures timed out after [n seconds] when working with Spark [duplicate]收到 TimeoutException 的可能原因是什么:使用 Spark 时,期货在 [n 秒] 后超时 [重复] 【发布时间】:2016-11-07 20:31:50 【问题描述】:

我正在开发 Spark SQL 程序,但收到以下异常:

16/11/07 15:58:25 ERROR yarn.ApplicationMaster: User class threw exception: java.util.concurrent.TimeoutException: Futures timed out after [3000 seconds]
java.util.concurrent.TimeoutException: Futures timed out after [3000 seconds]
    at scala.concurrent.impl.Promise$DefaultPromise.ready(Promise.scala:219)
    at scala.concurrent.impl.Promise$DefaultPromise.result(Promise.scala:223)
    at scala.concurrent.Await$$anonfun$result$1.apply(package.scala:190)
    at scala.concurrent.BlockContext$DefaultBlockContext$.blockOn(BlockContext.scala:53)
    at scala.concurrent.Await$.result(package.scala:190)
    at org.apache.spark.sql.execution.joins.BroadcastHashJoin.doExecute(BroadcastHashJoin.scala:107)
    at org.apache.spark.sql.execution.SparkPlan$$anonfun$execute$5.apply(SparkPlan.scala:132)
    at org.apache.spark.sql.execution.SparkPlan$$anonfun$execute$5.apply(SparkPlan.scala:130)
    at org.apache.spark.rdd.RDDOperationScope$.withScope(RDDOperationScope.scala:150)
    at org.apache.spark.sql.execution.SparkPlan.execute(SparkPlan.scala:130)
    at org.apache.spark.sql.execution.Project.doExecute(basicOperators.scala:46)
    at org.apache.spark.sql.execution.SparkPlan$$anonfun$execute$5.apply(SparkPlan.scala:132)
    at org.apache.spark.sql.execution.SparkPlan$$anonfun$execute$5.apply(SparkPlan.scala:130)
    at org.apache.spark.rdd.RDDOperationScope$.withScope(RDDOperationScope.scala:150)
    at org.apache.spark.sql.execution.SparkPlan.execute(SparkPlan.scala:130)
    at org.apache.spark.sql.execution.Union$$anonfun$doExecute$1.apply(basicOperators.scala:144)
    at org.apache.spark.sql.execution.Union$$anonfun$doExecute$1.apply(basicOperators.scala:144)
    at scala.collection.TraversableLike$$anonfun$map$1.apply(TraversableLike.scala:245)
    at scala.collection.TraversableLike$$anonfun$map$1.apply(TraversableLike.scala:245)
    at scala.collection.immutable.List.foreach(List.scala:381)
    at scala.collection.TraversableLike$class.map(TraversableLike.scala:245)
    at scala.collection.immutable.List.map(List.scala:285)
    at org.apache.spark.sql.execution.Union.doExecute(basicOperators.scala:144)
    at org.apache.spark.sql.execution.SparkPlan$$anonfun$execute$5.apply(SparkPlan.scala:132)
    at org.apache.spark.sql.execution.SparkPlan$$anonfun$execute$5.apply(SparkPlan.scala:130)
    at org.apache.spark.rdd.RDDOperationScope$.withScope(RDDOperationScope.scala:150)
    at org.apache.spark.sql.execution.SparkPlan.execute(SparkPlan.scala:130)
    at org.apache.spark.sql.execution.columnar.InMemoryRelation.buildBuffers(InMemoryColumnarTableScan.scala:129)
    at org.apache.spark.sql.execution.columnar.InMemoryRelation.<init>(InMemoryColumnarTableScan.scala:118)
    at org.apache.spark.sql.execution.columnar.InMemoryRelation$.apply(InMemoryColumnarTableScan.scala:41)
    at org.apache.spark.sql.execution.CacheManager$$anonfun$cacheQuery$1.apply(CacheManager.scala:93)
    at org.apache.spark.sql.execution.CacheManager.writeLock(CacheManager.scala:60)
    at org.apache.spark.sql.execution.CacheManager.cacheQuery(CacheManager.scala:84)
    at org.apache.spark.sql.DataFrame.persist(DataFrame.scala:1581)
    at org.apache.spark.sql.DataFrame.cache(DataFrame.scala:1590)
    at com.somecompany.ml.modeling.NewModel.getTrainingSet(FlowForNewModel.scala:56)
    at com.somecompany.ml.modeling.NewModel.generateArtifacts(FlowForNewModel.scala:32)
    at com.somecompany.ml.modeling.Flow$class.run(Flow.scala:52)
    at com.somecompany.ml.modeling.lowForNewModel.run(FlowForNewModel.scala:15)
    at com.somecompany.ml.Main$$anonfun$2.apply(Main.scala:54)
    at com.somecompany.ml.Main$$anonfun$2.apply(Main.scala:54)
    at scala.Option.getOrElse(Option.scala:121)
    at com.somecompany.ml.Main$.main(Main.scala:46)
    at com.somecompany.ml.Main.main(Main.scala)
    at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
    at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:62)
    at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43)
    at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:498)
    at org.apache.spark.deploy.yarn.ApplicationMaster$$anon$2.run(ApplicationMaster.scala:542)
16/11/07 15:58:25 INFO yarn.ApplicationMaster: Final app status: FAILED, exitCode: 15, (reason: User class threw exception: java.util.concurrent.TimeoutException: Futures timed out after [3000 seconds])

我从堆栈跟踪中识别出的代码的最后一部分是com.somecompany.ml.modeling.NewModel.getTrainingSet(FlowForNewModel.scala:56),这让我进入了这一行:profilesDF.cache() 在缓存之前,我在 2 个数据帧之间执行联合。我已经看到了一个关于在加入之前保留两个数据帧的答案here 我仍然需要缓存联合数据帧,因为我在我的几个转换中使用它

我想知道什么可能导致抛出这个异常? 搜索它让我找到了处理 rpc 超时异常或一些安全问题的链接,这不是我的问题 如果您对如何解决它也有任何想法,我显然会很感激,但即使只是理解问题也会帮助我解决它

提前致谢

【问题讨论】:

【参考方案1】:

问题:我想知道什么可能导致抛出此异常?

答案:

spark.sql.broadcastTimeout 300 Timeout in seconds for the broadcast wait time in broadcast joins

spark.network.timeout 120s 所有网络交互的默认超时时间.. spark.network.timeout (spark.rpc.askTimeout), spark.sql.broadcastTimeout, spark.kryoserializer.buffer.max(如果你使用的是 kryo 序列化)等使用大于默认值的值进行调整 为了处理复杂的查询。您可以从这些值开始 根据您的 SQL 工作负载进行相应调整。

注意:Doc says that

以下选项(参见 spark.sql. 属性)也可用于调整查询执行的性能。这些选项可能会在未来的版本中被弃用,因为更多的优化会自动执行。*

此外,为了更好地理解,您可以查看BroadCastHashJoin,其中执行方法是上述堆栈跟踪的触发点。

protected override def doExecute(): RDD[Row] = 
    val broadcastRelation = Await.result(broadcastFuture, timeout)

    streamedPlan.execute().mapPartitions  streamedIter =>
      hashJoin(streamedIter, broadcastRelation.value)
    
  

【讨论】:

【参考方案2】:

很高兴知道 Ram 的建议在某些情况下有效。我想提一下,我偶然发现了这个异常几次(包括描述的here)。

大部分时间,这是由于某些执行程序上几乎无声的 OOM。检查 SparkUI 是否有失败的任务,该表的最后一列: 您可能会注意到 OOM 消息。

如果对 spark 内部结构了解得很好,广播的数据会通过驱动程序。所以驱动程序有一些线程机制来收集来自执行程序的数据,并将其发送回所有人。如果在某些时候执行程序失败,您可能会遇到这些超时。

【讨论】:

【参考方案3】:

我在向Yarn-cluster提交作业时设置了master as local[n]

在集群上运行时不要在代码中设置master,而是使用--master

【讨论】:

你能解释一下为什么会出现这个问题吗?【参考方案4】:

如果您启用了 dynamicAllocation,请尝试禁用此配置 (spark.dynamicAllocation.enabled=false)。您可以在 conf/spark-defaults.conf 下设置此 spark 配置,如 --conf 或在代码中。

另见:

https://issues.apache.org/jira/browse/SPARK-22618

https://issues.apache.org/jira/browse/SPARK-23806

【讨论】:

以上是关于收到 TimeoutException 的可能原因是啥:使用 Spark 时,期货在 [n 秒] 后超时 [重复]的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

使用 BehaviorSubject 的测试中的 TimeoutException - BLoC

等待具有超时的期货序列,而不会在 TimeoutException 上失败

after_step中的HOOK-ERROR:TimeoutException:消息:超时

kafka.common.errors.TimeoutException:Timeout expired while fetching topic metadata

kafkaStream执行过程中出现TimeoutException异常退出

org.apache.kafka.common.errors.TimeoutException: Topic not present in metadata 解决方法