如何诊断为啥在 MATLAB 中执行 .mex 文件时无法加载 .so 文件？

Posted 2023-02-16

【中文标题】如何诊断为啥在 MATLAB 中执行 .mex 文件时无法加载 .so 文件？

【英文标题】：How do I diagnose why a .so file won't load when executing a .mex file in MATLAB?如何诊断为什么在 MATLAB 中执行 .mex 文件时无法加载 .so 文件？

【发布时间】：2010-07-29 18:59:49

【问题描述】：

我正在尝试将名为 VideoIO 的视频库与 MATLAB 一起用于机器学习项目。当我尝试在 MATLAB 中调用该库时，我收到一条错误消息，指出它找不到 libavutil.so.50，这是 VideoIO 所依赖的 ffmpeg 库之一。我检查了一些不同的东西，但除了它没有运行之外，找不到任何看起来错误的东西。谁能建议其他检查以帮助我调试？

这是错误：

error while loading shared libraries: libavutil.so.50: cannot open shared object file: No such file or directory 
??? Error using ==> videoReader_ffmpegPopen2 EOF found while trying to read the communication tag.
The server process probably died.
String so far: "" Function: int VideoIO::readMessageHeader(FILE*)
File : pipecomm.h Line : 306
Error in ==> videoReader.videoReader at 152 vr.handle = feval(vr.plugin, 'open',vr.handle, ...

试图找出问题所在，我发现vr 分配在哪里：

 vr = struct('plugin',pvtVideoIO_mexName(mfilename, plugin), ... 'handle',int32(-1));

我打印出mfilename，然后在它指向的文件上运行ldd：

$ ldd videoReader_ffmpegPopen2Server
linux-vdso.so.1 => (0x00007fff41dff000)
libavutil.so.50 => /u/goodfeli/ffmpeg/libavutil/libavutil.so.50 (0x00007fd5f2895000)
libavdevice.so.52 => /u/goodfeli/ffmpeg/libavdevice/libavdevice.so.52 (0x00007fd5f268c000)
libavformat.so.52 => /u/goodfeli/ffmpeg/libavformat/libavformat.so.52 (0x00007fd5f23bf000)
libavcodec.so.52 => /u/goodfeli/ffmpeg/libavcodec/libavcodec.so.52 (0x00007fd5f1792000)
libavfilter.so.1 => /u/goodfeli/ffmpeg/libavfilter/libavfilter.so.1 (0x00007fd5f1584000)
libswscale.so.0 => /u/goodfeli/ffmpeg/libswscale/libswscale.so.0 (0x00007fd5f1351000)
libstdc++.so.6 => /usr/lib64/libstdc++.so.6 (0x000000378ea00000)
libm.so.6 => /lib64/libm.so.6 (0x0000003788a00000)
libgcc_s.so.1 => /lib64/libgcc_s.so.1 (0x000000378c600000)
libc.so.6 => /lib64/libc.so.6 (0x0000003788600000)
libpthread.so.0 => /lib64/libpthread.so.0 (0x0000003789200000)
libasound.so.2 => /lib64/libasound.so.2 (0x000000379a200000)
libbz2.so.1 => /lib64/libbz2.so.1 (0x0000003b0b400000)
libz.so.1 => /lib64/libz.so.1 (0x0000003789600000)
/lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x0000003787400000)
libdl.so.2 => /lib64/libdl.so.2 (0x0000003788e00000)
librt.so.1 => /lib64/librt.so.1 (0x000000378b200000)

现在，通过复制粘贴 libavutil 的路径，我验证它是否正确：

$ ls /u/goodfeli/ffmpeg/libavutil/libavutil.so.50
/u/goodfeli/ffmpeg/libavutil/libavutil.so.50

所以该文件存在。现在在 MATLAB 中，我检查了 MATLAB 的 LD_LIBRARY_PATH 变量：

 >> getenv('LD_LIBRARY_PATH')
ans = /soft/diro/share/matlabr2009b/sys/os/glnxa64:/soft/diro/share/matlabr2009b/bin/glnxa64:/soft/diro/share/matlabr2009b/extern/lib/glnxa64:/soft/diro/share/matlabr2009b/runtime/glnxa64:/soft/diro/share/matlabr2009b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/native_threads:/soft/diro/share/matlabr2009b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/server:/soft/diro/share/matlabr2009b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64:/u/goodfeli/ffmpeg/libavfilter:/u/goodfeli/ffmpeg/libswscale:/u/goodfeli/ffmpeg/libavdevice:/u/goodfeli/ffmpeg/libavformat:/u/goodfeli/ffmpeg/libavcodec:/u/goodfeli/ffmpeg/libavutil:/opt/lisa/os/cuda/lib64:/opt/lisa/os/cuda/lib:/opt/lisa/byhost/lib:/opt/lisa/os/lib/vtk:/opt/lisa/os/lib/intelmkl/lib/32:/opt/lisa/os/lib:/opt/lisa/os/lib64:/usr/local/lib:/usr/lib64/atlas/::/opt/lisa/os/panda/lib:/opt/lisa/os/lib32:/opt/lisa/byhost/lib32

这似乎是正确的，它包括/u/goodfeli/ffmpeg/libavutil/，通过复制粘贴我可以验证没有错字：

 $ ls /u/goodfeli/ffmpeg/libavutil/ | grep "\.so"

对接下来要检查的内容有什么建议吗？提前致谢。

【参考方案1】：

在调用 Matlab 之前设置 export LD_DEBUG=libs 可能会提供线索。

【讨论】：

谢谢，原来在 makefile 中存在问题，它将完整的文件路径而不是子目录作为 rpath 的参数。我会投票给你，但我需要 15 声望才能投票。