rcpp中没有匹配的调用函数

Posted 2023-02-16

【中文标题】rcpp中没有匹配的调用函数

【英文标题】：no matching function for call in rcpp

【发布时间】：2020-07-10 01:33:54

【问题描述】：

使用 Rcpp 时，我创建了一个名为 rpois_rcpp 的函数，并尝试在下面的 genDataList 函数中调用它，出现错误并说： “调用‘cpprbinom’没有匹配的函数， 候选函数不可行：第三个参数没有从 'arma::vec'（又名 'Col'）到 'Rcpp::NumericVector'（又名'Vector'）的已知转换 arma::vec cpprbinom(int n, double size, NumericVector prob).

谁能帮帮我，谢谢！

这是我的代码：

//create a random matrix X with covariance matrix sigma
// [[Rcpp::export]]
arma::mat mvrnormArma(const int n, arma::vec mu, const int p, const 
double rho) 

  arma::mat sigma(p, p, arma::fill::zeros);

  for (int i = 0; i < sigma.n_rows; ++i) 
    for (int j = 0; j < sigma.n_cols; ++j) 
      sigma(i,j) = pow(rho, abs((i + 1) - (j + 1)));
    
  

  int ncols = sigma.n_cols;
  arma::mat Y = arma::randn(n, ncols);


  return arma::repmat(mu, 1, n).t() + Y * arma::chol(sigma);


//create a vector sampled from poisson distribution with mean vector 
//lambda
// [[Rcpp::export]]
arma::vec rpois_rcpp( NumericVector &lambda) 
  int n= lambda.length();
  unsigned int lambda_i = 0;
  IntegerVector sim(n);
  for (unsigned int i = 0; i < n; i++) 
    sim[i] = R::rpois(lambda[lambda_i]);
    // update lambda_i to match next realized value with correct mean
    lambda_i++;

  
  return  as<arma::vec>(sim);


//create a vector sampled from binomial distribution with probability 
vector prob
// [[Rcpp::export]]
arma::vec cpprbinom(int n, double size, NumericVector prob)  
  NumericVector v = no_init(n);
  std::transform( prob.begin(), prob.end(), v.begin(), [=](double p) 
      return R::rbinom(size, p); ); 
  return as<arma::vec>(v);




// [[Rcpp::export]]44
List genDataList(int n, arma::vec& mu, int p, double rho,
             arma::vec& beta, const double SNR, const std::string & 
  Test_case) 

  arma::mat U, V, data, normData, Projection;
  arma::vec s, y, means, noise;

  data = mvrnormArma(n, mu, p, rho);
  normData = arma::normalise(data,2,0);
  arma::svd_econ(U,s,V,normData,"right");
  Projection = V * trans(V);
  beta = Projection * beta;


  if(Test_case == "gaussian")
  
    means=normData * beta;
    y = means + arma::randn(n) * sqrt(arma::var(means) / SNR);
  else if (Test_case == "poisson")
  
    means=exp(normData * beta);
    y = rpois_rcpp(means);
  else
  
    means=exp(normData * beta)/(1 + exp(normData * beta));
    y = cpprbinom(n,1,means);




  List ret;
  ret["data"] = data;
  ret["normData"] = normData;
  ret["V"] = V;
  ret["beta"] = beta;
  ret["y"] = y;
  return ret;

  

【问题讨论】：

在 *** 上，代码必须是文本并且在问题中。

正如@drescherjm 建议的那样，如果您edit您的问题将您的代码作为文本复制并粘贴到您的问题本身（我们不能很好地复制和粘贴您的代码），这将有助于我们帮助您从图像中可以自己检查出来）

欢迎来到 ***！看看标签[rcpp] 的现有问题——你的问题目前还没有我们可以添加很多的形式。 mcve 会有很大帮助。

@duckmayr @Dirk Eddelbuettel @drescherjm 非常感谢我刚刚解决了这个问题

你好 Mohan，欢迎来到 ***，只是一个问题，你如何应用你的函数？你能分享一个示例数据集和你在 R 中的函数吗？

【参考方案1】：

感谢您添加代码。当我尝试编译时，我得到了和你一样的错误，但是也调用rpois_rcpp()的行出错了

对类型 'Rcpp::NumericVector&' 的引用初始化无效

几乎所有东西似乎都在arma 中，除了R 绑定和对R:: 命名空间的调用，它需要双精度、整数等。这似乎是最简单的事情（在我看来），只是取 arma::vec 作为参数：

arma::vec rpois_rcpp( arma::vec &lambda) 
    int n= lambda.n_elem;

和

    arma::vec cpprbinom(int n, double size, arma::vec prob)  

你永远不会利用lambda 和prob 是Rcpp::NumericVectors 的事实，你只是使用他们的doubles，所以这对我来说似乎是最简单的方法。在这些更改之后，您的代码可以在我的机器上正常编译。我没有任何测试用例来确保它们按您的预期运行，但我想它们会的。

【讨论】：

非常感谢，它可以在我的电脑上运行。我通常对使用哪一个感到困惑，numeric vector 还是 arma::vec，这个真的很有帮助！