使用 MPI.NET 和 Mono 框架在超级计算机的 linux 节点上执行分布式计算

Posted 2023-03-27

【中文标题】使用 MPI.NET 和 Mono 框架在超级计算机的 linux 节点上执行分布式计算

【英文标题】：Using MPI.NET and Mono framework to execute distributed computing on linux nodes of a supercomputer

【发布时间】：2014-04-04 17:39:21

【问题描述】：

我想知道是否可以使用 MPI.NET + Mono 框架在全部基于 Linux 的超级计算机节点上运行分布式计算？

我知道 Mono 运行时在集群上可用，并且带有标准库的单声道编译程序运行良好。但是 MPI.NET 呢？

还有一个问题，我对 MPI.NET 和 MPIch2 等之间的区别有点困惑。如果 MPIch2 可用，MPI.NET 是标准 MPIch2 的包装器，并且可以在 Linux 上工作吗？或者它是 MPIch2 的替代品并且需要安装 MPI.NET 客户端？

如果您对此有任何经验，我非常感谢您的意见。

谢谢。

【参考方案1】：

在我开始之前，当您有多个问题时，您应该分别发布它们。我不知道你问题第一部分的答案，但我可以帮助你解决第二部分。这意味着，如果您喜欢我的回答和另一个，则不能同时接受。无论如何，进入你问题的后半部分。

MPI.NET 是一个 MPI 实现，似乎运行在 Boost MPI 之上。这意味着它可能不会自己实现低级通信调用，而是具有 .NET 绑定，允许您从任何这些语言调用 Boost MPI。如果两者都没有安装，它将无法正常工作。

MPICH（该项目不再称为 MPICH2）是 MPI 标准的单独实现，它确实提供了在堆栈的所有级别上运行在大多数系统上所需的一切。它提供了所有标准所需的语言绑定（C、FORTRAN 和已弃用的 C++）。这两个项目是分开的，据我所知，您不能在 MPICH 之上使用 MPI.NET。

【讨论】：

嗯，我实际上并不认为你已经回答了我的任何问题。你只是列出了 MPI.NET 和 MPICH 的非常笼统的定义，我认为你对 MPICH 的看法是值得商榷的，因此看起来对于以前在 Linux 系统上使用 mono 做过此操作的人。话虽如此，经过进一步调查，我在 MPI.NET 网站上发现了这一点，并引用：“支持通过 Mono 使用 Open MPI、LAM/MPI 或 MPICH2 作为本机 MPI 在类 Unix 平台上进行编译。”这就是令人困惑的地方。但是感谢您的尝试。

【参考方案2】：

我终于从 MPI.NET 网站上找到了关于这个问题的一些问题的答案。我引用：

MPI.NET 是否可以与其他 MPI 实现一起使用？ 这取决于平台。尽管 MPI 是一种标准，但在 Windows 上，MPI.NET 对一些有关 MS-MPI 中使用的特定数据类型的信息进行编码，这些信息将 MPI.NET 直接与 Microsoft 的 MPI 联系起来。让 MPI.NET 与其他 MPI 实现一起工作当然是可能的，但我们目前不打算这样做。然而，在 Unix 上，MPI.NET 会自行适应在配置时检测到的本机 MPI，并且可以（至少）与 Open MPI、LAM/MPI 和 MPICH2 一起使用

MPI.NET 可以与 Mono 一起使用吗？ 是的！从 0.6.0 版本开始，MPI.NET 在 Mono 下使用各种不同的本地 MPI，包括 Open MPI、LAM/MPI 和 MPICH2。但是请注意，Mono 中的运行时代码生成问题会导致 MPI.NET 在优化方面稍微保守一些。由于这种更保守的方法以及 Mono JIT 没有像 Microsoft JIT 那样得到那么多调整的事实，我们预计 Mono 的性能不会那么好。

更多信息请访问：MPI FAQ

另外，这里有一个关于如何在 Ubuntu 下编译 MPI.NET 的链接：Compiling MPI.NET under Ubuntu Oneiric