是否可以以特定名称加载 Granges .Rdata 文件？

Posted 2023-03-25

【中文标题】是否可以以特定名称加载 Granges .Rdata 文件？

【英文标题】：Is it possible to load a Granges .Rdata file under a specific name?

【发布时间】：2019-04-02 08:05:57

【问题描述】：

我正在尝试打开一个 Granges 文件，我想将它存储在特定名称而不是文件名下，以便以后可以在函数和循环中使用该文件。以下工作正常，但将文件保存在名称“grs”下。

load("~/data/grs_xxx.Rdata")
> head(grs)

GRanges object with 6 ranges and 0 metadata columns:
         seqnames      ranges strand
            <Rle>   <IRanges>  <Rle>
  [1] NC_007070.3 27001-27100      *
  [2] NC_007070.3 27051-27150      *
  [3] NC_007070.3 27101-27200      *
  [4] NC_007070.3 27151-27250      *
  [5] NC_007070.3 27201-27300      *
  [6] NC_007070.3 27251-27350      *
  -------

如果我尝试分配它；

    test <- load("~/data/grs_xxx.Rdata")
> head(test)
[1] "grs"

有没有不影响 Granges 表的解决方法？

【参考方案1】：

我无法找到仅使用 load() 解决此问题的直接方法，但我可以使用我发现的解决方法；

How can I load an object into a variable name that I specify from an R data file?

用户里卡多发帖；

loadRData <- function(fileName)
#loads an RData file, and returns it
   load(fileName)
   get(ls()[ls() != "fileName"])

d <- loadRData("~/blah/ricardo.RData")