无法部署 ShinyApp：readTableHeader 在“raw”上找到不完整的最后一行（使用默认值：en_US）
Posted
技术标签:
【中文标题】无法部署 ShinyApp：readTableHeader 在“raw”上找到不完整的最后一行（使用默认值：en_US）【英文标题】：Cannot deploy ShinyApp: incomplete final line found by readTableHeader on 'raw' (Using default: en_US) 【发布时间】：2021-03-17 23:35:30 【问题描述】：我已经拼命尝试部署我的 shinyApp 大约一个星期了，但不幸的是我无法停止收到以下消息：
Warning message: Error detecting locale: Error in read.table(file = file, header = header, sep = sep, quote = quote, : incomplete final line found by readTableHeader on 'raw' (Using default: en_US)
我查看了debugging Shiny app page，并使用了“展示模式”来尝试追踪脚本中的潜在问题。但是当我在本地运行“展示模式”代码 (shiny::runApp(display.mode="showcase")) 时，我会收到以下警告消息：
Warning: Error in file.path: cannot coerce type 'closure' to vector of type 'character'
正如 YBS 在 cmets 中解释的那样，这个错误实际上是一个闪亮的错误，但是我看不到如何调试我的脚本以部署我的应用程序（我已经尝试在末尾添加一个空行我的每个 csv 文件，但它没有帮助）
有人已经遇到过这个问题吗？
我的应用：https://gitlab.com/wanderzen/shiny_app/-/blob/master/ZABR.rar
注意：如果我使用 shinyApp(ui, server) ，我的应用程序在本地运行起来就像魅力一样
以下是关于我的会话的一些信息：
# sessionInfo()
R version 4.0.0 (2020-04-24)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 18363)
Matrix products: default
locale:
[1] LC_COLLATE=French_France.1252 LC_CTYPE=French_France.1252 LC_MONETARY=French_France.1252
[4] LC_NUMERIC=C LC_TIME=French_France.1252
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] sp_1.4-1
loaded via a namespace (and not attached):
[1] Rcpp_1.0.4.6 BiocManager_1.30.10 compiler_4.0.0 pillar_1.4.4
[5] later_1.0.0 tools_4.0.0 packrat_0.5.0 digest_0.6.25
[9] jsonlite_1.6.1 tibble_3.0.1 lifecycle_0.2.0 lattice_0.20-41
[13] pkgconfig_2.0.3 rlang_0.4.9 shiny_1.4.0.2 rstudioapi_0.11
[17] curl_4.3 xfun_0.13 fastmap_1.0.1 dplyr_0.8.5
[21] htmlwidgets_1.5.1 vctrs_0.3.0 askpass_1.1 grid_4.0.0
[25] DT_0.16 tidyselect_1.1.0 glue_1.4.1 R6_2.4.1
[29] purrr_0.3.4 magrittr_1.5 promises_1.1.0 ellipsis_0.3.1
[33] htmltools_0.5.0 rsconnect_0.8.16 assertthat_0.2.1 mime_0.9
[37] xtable_1.8-4 httpuv_1.5.2 tinytex_0.23 openssl_1.4.1
[41] crayon_1.3.4
# packageVersion("shiny")
[1] ‘1.4.0.2’
【问题讨论】：
尝试将名为subset 的响应式对象更改为 subset1。
其实这可能是shiny中的一个bug。请参阅here
感谢 YBS 的回答！这似乎确实是一个错误......在那种情况下，当我尝试部署我的应用程序时，我看不到任何方法来检查我的脚本的哪一部分可能导致第一条错误消息：/我已经尝试过一切（例如： ***.com/questions/22171858/…)
如果您关注community.rstudio.com/t/…，...如果您升级到最新的闪亮版本，问题可能会得到解决。正如所见，您在本地没有最新版本的闪亮包。因此，部署服务器上的闪亮包也可能不是最新的。您可以尝试使用 install.packages("shiny") 更新部署服务器上的软件包，或者使用 remotes::install_github("rstudio/shiny") 甚至更好地使用最新的开发版本
如果读取 csv 有问题，请尝试将其转换为 rds 格式，然后改为读取。
【参考方案1】：
我花了很长时间逐个调试我的应用程序流，但我最终发现了导致所有问题的原因！
我一直在我的脚本中同时使用 dplyr::filter(variable== input$variable) 和 filter((variable == input$variable)，直到我意识到它们的冲突是我闪亮的应用程序故障的原因。
https://github.com/STAT545-UBC/Discussion/issues/331#issuecomment-249048018
【讨论】：
【参考方案2】：我猜问题不是来自 Shiny，而是来自本地测试机器和您尝试在其上部署应用的 Shiny 服务器之间的不同区域设置。
您分享的脚本显示您使用了六次read.csv，您得到的错误类似于'Incomplete final line' warning when trying to read a .csv file into R
首先，我会尝试使用read.csv2 而不是read.csv，因为它更适合法语设置，请参阅doc：
;
小数分隔符,
如果这还不够，您尝试加载的文件之一在最后一行缺少 EOL。
work around 是将readLines 插入read.csv2：
read.csv2(text = readLines("yourfilename.csv", warn = FALSE),header=T)
【讨论】：
感谢您的回复瓦尔迪！我已经使用函数read.table(file.choose(),header=TRUE,sep=",") 来检查我的csv 文件是否存在问题，但是以这种方式导入我的文件时我没有收到任何警告消息...我也尝试了read.csv2(text = readLines("yourfilename.csv", warn = FALSE),header=T) 的建议，但它没有解决不了问题:(
注意：我已在此处添加了包含我的文件的文件夹：gitlab.com/wanderzen/shiny_app/-/blob/master/ZABR.rar
您是在本地机器上还是在服务器上测试了read.csv？我有可能在服务器上启动 R 会话，确保read.csv 找到文件并在那里读取没有问题会很有用。我经常在 windows 中的文本文件与在 linux 服务器上复制的相同文本文件之间遇到 EOL 惊喜。
感谢您提供的文件，我将在我的 linux 闪亮服务器上尝试它们：我将看看是否可以重现问题
在我的服务器上加载 csv 文件时没有出错。您是否尝试在服务器上的控制台中运行 R？我在server.R 中看到的另一点，你写了read.csv2(text = readLines("yourfilename.csv"), warn = FALSE,header=T) 而不是正确的语法：read.csv2(text = readLines("yourfilename.csv", warn = FALSE),header=T) 以上是关于无法部署 ShinyApp：readTableHeader 在“raw”上找到不完整的最后一行（使用默认值：en_US）的主要内容，如果未能解决你的问题，请参考以下文章
R：在已部署的 ShinyApp 中仅加载一次 .RData
从自己的（Linux）服务器和自己的域托管 ShinyApp