如何使用 scikit-learn 组合具有不同维度输出的特征
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【中文标题】如何使用 scikit-learn 组合具有不同维度输出的特征【英文标题】:How to combine features with different dimensions output using scikit-learn 【发布时间】:2018-10-30 06:32:59 【问题描述】:我正在使用 scikit-learn 与 Pipeline 和 FeatureUnion 从不同的输入中提取特征。我的数据集中的每个样本(实例)都引用了不同长度的文档。我的目标是独立计算每个文档的顶部 tfidf,但我不断收到此错误消息:
ValueError: blocks[0,:] 的行尺寸不兼容。得到 blocks[0,1].shape[0] == 1,预计 2000 年。
2000 是训练数据的大小。 这是主要代码:
book_summary= Pipeline([
('selector', ItemSelector(key='book')),
('tfidf', TfidfVectorizer(analyzer='word', ngram_range(1,3), min_df=1, lowercase=True, stop_words=my_stopword_list, sublinear_tf=True))
])
book_contents= Pipeline([('selector3', book_content_count())])
ppl = Pipeline([
('feats', FeatureUnion([
('book_summary', book_summary),
('book_contents', book_contents)])),
('clf', SVC(kernel='linear', class_weight='balanced') ) # classifier with cross fold 5
])
我编写了两个类来处理每个管道函数。我的问题是 book_contents 管道,它主要处理每个样本并独立返回每本书的 TFidf 矩阵。
class book_content_count():
def count_contents2(self, bookid):
book = open('C:/TheCorpus/'+str(int(bookid))+'_book.csv', 'r')
book_data = pd.read_csv(book, header=0, delimiter=',', encoding='latin1',error_bad_lines=False,dtype=str)
corpus=(str([user_data['text']]).strip('[]'))
return corpus
def transform(self, data_dict, y=None):
data_dict['bookid'] #from here take the name
text=data_dict['bookid'].apply(self.count_contents2)
vec_pipe= Pipeline([('vec', TfidfVectorizer(min_df = 1,lowercase = False, ngram_range = (1,1), use_idf = True, stop_words='english'))])
Xtr = vec_pipe.fit_transform(text)
return Xtr
def fit(self, x, y=None):
return self
数据样本(示例):
title Summary bookid
The beauty and the beast is a traditional fairy tale... 10
ocean at the end of the lane is a 2013 novel by British 11
那么每个id都会引用一个包含这些书籍实际内容的文本文件
我尝试过toarray
和reshape
函数,但没有成功。任何想法如何解决这个问题。
谢谢
【问题讨论】:
能否提供一些示例数据? 我添加了数据示例 理想情况下,您将提供一个最小的工作示例来重现您的错误。目前你指的是book_content_count()
,我无法从你的代码中识别出来。
这不能在 FeatureUnion 中完成。它在内部使用numpy.hstack,这要求所有部分的行数相等。第一部分'book_summary'
将处理整个训练数据并返回一个包含 2000 行的矩阵。但是您的第二部分 'book_contents'
将只返回一行。您将如何组合这些数据?
只是古玩,您找到解决方案了吗?请注意,“每个文档独立的 tfidf”等价于 countvectorizer。
【参考方案1】:
您可以将Neuraxle's Feature Union 与需要自己编码的自定义连接器一起使用。 joiner 是一个传递给 Neuraxle 的 FeatureUnion 的类,用于以您期望的方式将结果合并在一起。
1。导入 Neuraxle 的类。
from neuraxle.base import NonFittableMixin, BaseStep
from neuraxle.pipeline import Pipeline
from neuraxle.steps.sklearn import SKLearnWrapper
from neuraxle.union import FeatureUnion
2。通过继承 BaseStep 来定义您的自定义类:
class BookContentCount(BaseStep):
def transform(self, data_dict, y=None):
transformed = do_things(...) # be sure to use SKLearnWrapper if you wrap sklearn items.
return transformed
def fit(self, x, y=None):
return self
3。创建一个加入者,以您希望的方式加入特征联合的结果:
class CustomJoiner(NonFittableMixin, BaseStep):
def __init__(self):
BaseStep.__init__(self)
NonFittableMixin.__init__(self)
# def fit: is inherited from `NonFittableMixin` and simply returns self.
def transform(self, data_inputs):
# TODO: insert your own concatenation method here.
result = np.concatenate(data_inputs, axis=-1)
return result
4。最后通过将连接器传递给 FeatureUnion 来创建您的管道:
book_summary= Pipeline([
ItemSelector(key='book'),
TfidfVectorizer(analyzer='word', ngram_range(1,3), min_df=1, lowercase=True, stop_words=my_stopword_list, sublinear_tf=True)
])
p = Pipeline([
FeatureUnion([
book_summary,
BookContentCount()
],
joiner=CustomJoiner()
),
SVC(kernel='linear', class_weight='balanced')
])
注意:如果您希望您的 Neuraxle 管道恢复为 scikit-learn 管道,您可以执行 p = p.tosklearn()
。
要了解有关 Neuraxle 的更多信息: https://github.com/Neuraxio/Neuraxle
文档中的更多示例: https://www.neuraxle.org/stable/examples/index.html
【讨论】:
以上是关于如何使用 scikit-learn 组合具有不同维度输出的特征的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
使用 scikit-learn 时,如何找到我的树分裂的属性?
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