用特征名称绘制特征重要性
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【中文标题】用特征名称绘制特征重要性【英文标题】:Plot Feature Importance with feature names 【发布时间】:2017-11-14 15:35:51 【问题描述】:在 R 中有预先构建的函数来绘制随机森林模型的特征重要性。但在 python 中,似乎缺少这种方法。我在matplotlib
中搜索一个方法。
model.feature_importances
给了我以下信息:
array([ 2.32421835e-03, 7.21472336e-04, 2.70491223e-03,
3.34521084e-03, 4.19443238e-03, 1.50108737e-03,
3.29160540e-03, 4.82320256e-01, 3.14117333e-03])
然后使用以下绘图功能:
>> pyplot.bar(range(len(model.feature_importances_)), model.feature_importances_)
>> pyplot.show()
我得到了一个条形图,但我想得到带有标签的条形图,同时重要性以排序的方式水平显示。我也在探索seaborn
,但找不到方法。
【问题讨论】:
您正在寻找barh
(水平条形图)。将功能名称传递为tick_label
s。
【参考方案1】:
为没有时间浪费的数据科学家提供快速解答:
将特征重要性加载到按列名索引的 pandas 系列中,然后使用它的 plot 方法。对于使用X
训练的分类器model
:
feat_importances = pd.Series(model.feature_importances_, index=X.columns)
feat_importances.nlargest(20).plot(kind='barh')
稍微详细一点的答案,附上一个完整的例子:
假设您使用 pandas 数据框中包含的数据训练模型,如果您将特征重要性加载到 pandas 系列中,这将相当轻松,然后您可以利用它的索引来轻松显示变量名称。 plot 参数kind='barh'
为我们提供了一个水平条形图,但如果您愿意,您可以很容易地用这个参数替换kind='bar'
以获得沿x 轴的特征名称的传统条形图。
nlargest(n)
是 pandas Series 方法,它将返回具有最大 n
值的系列子集。如果您的模型中有很多特征并且您只想绘制最重要的特征,这将非常有用。
使用经典 Kaggle Titanic 数据集的快速完整示例...
import pandas as pd
from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier
%matplotlib inline # don't forget this if you're using jupyter!
X = pd.read_csv("titanic_train.csv")
X = X[['Pclass', 'Age', 'Fare', 'Parch', 'SibSp', 'Survived']].dropna()
y = X.pop('Survived')
model = RandomForestClassifier()
model.fit(X, y)
(pd.Series(model.feature_importances_, index=X.columns)
.nlargest(4)
.plot(kind='barh')) # some method chaining, because it's sexy!
这会给你这个:
【讨论】:
如果我想在 y 轴上翻转这个图怎么办?如,先显示年龄,然后显示票价等 @ArtTatum Callinvert_yaxis()
- 示例用法pd.Series(model.feature_importances_, index=X.columns).nlargest(4).plot(kind='barh').invert_yaxis()
快速而神奇!【参考方案2】:
不完全确定您在寻找什么。从here 派生一个示例。如评论中所述:如果要自定义功能标签,可以将indices
更改为plt.yticks(range(X.shape[1]), indices)
行的标签列表。
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.datasets import make_classification
from sklearn.ensemble import ExtraTreesClassifier
# Build a classification task using 3 informative features
X, y = make_classification(n_samples=1000,
n_features=10,
n_informative=3,
n_redundant=0,
n_repeated=0,
n_classes=2,
random_state=0,
shuffle=False)
# Build a forest and compute the feature importances
forest = ExtraTreesClassifier(n_estimators=250,
random_state=0)
forest.fit(X, y)
importances = forest.feature_importances_
std = np.std([tree.feature_importances_ for tree in forest.estimators_],
axis=0)
indices = np.argsort(importances)
# Plot the feature importances of the forest
plt.figure()
plt.title("Feature importances")
plt.barh(range(X.shape[1]), importances[indices],
color="r", xerr=std[indices], align="center")
# If you want to define your own labels,
# change indices to a list of labels on the following line.
plt.yticks(range(X.shape[1]), indices)
plt.ylim([-1, X.shape[1]])
plt.show()
【讨论】:
通过将这一行plt.yticks(range(X.shape[1]), indices)
替换为 plt.yticks(range(X.shape[1]), [feature_names[i] for i in indices])
,我得到了出现在 y 轴上的功能名称而不是索引号【参考方案3】:
可以只传递df.columns
作为plt.xticks()
的参数:
plt.bar( range(len(model.feature_importances_)), model.feature_importances_)
plt.xticks(range(len(model.feature_importances_)), train_features.columns)
plt.show()
【讨论】:
以上是关于用特征名称绘制特征重要性的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章