ValueError：数组不能在 Python3.X 的 SpectralCoclustering 中包含 infs 或 NaNs

Posted 2023-03-12

【中文标题】ValueError：数组不能在 Python3.X 的 SpectralCoclustering 中包含 infs 或 NaNs

【英文标题】：ValueError: array must not contain infs or NaNs in SpectralCoclustering in Python3.X

【发布时间】：2017-12-25 05:11:15

【问题描述】：

data = np.genfromtxt("breastCancer.txt", delimiter=',').astype(np.float32)
data = data[~np.isnan(data).any(axis=1)]

ROW, COLUMN = data.shape

label = data[:, -1]
input = data[:, 1:COLUMN - 1]

scaler = preprocessing.MinMaxScaler(feature_range=(-1.0, 1.0))
scaler.fit(input)
input = scaler.transform(input)

model = SpectralCoClustering(n_clusters=3, random_state=0)
model.fit(input)

我尝试对 (-1.0, 1.0) 范围内的数据集进行双聚类。在我的数据中，我没有任何 inf 或 nan。但它会引发ValueError: array must not contain infs or NaNs in SpectralCoclustering 的错误。你能帮我么？我需要一个范围 (-1, 1) 中的数据集，所以我不想在正范围内更改它。

【问题讨论】：

我尝试了 [0,1] 范围内的数据集。它也会引发同样的错误。

【参考方案1】：

我花了两天时间解决了同样的问题。我的解决方案：在做model.fit(input) 之前，我从input 中删除了只有零的列：

remaining_collumns=input.getnnz(1)>0
input=input[remaining_collumns,:]
model.fit(input)

另请注意，在我的情况下，input 由TfidfVectorizer.fit_transform 返回，格式为sparse.csr.csr_matrix

【讨论】：

嗨！只是想让您知道，您今天帮助了一名数据科学学生（又名我）完成了他的课程！非常感谢！！