do_one(nmeth) 中的错误：外部函数调用中的 NA/NaN/Inf (arg 1)

Posted 2023-03-12

【中文标题】do_one(nmeth) 中的错误：外部函数调用中的 NA/NaN/Inf (arg 1)

【英文标题】：Error in do_one(nmeth) : NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 1)

【发布时间】：2016-07-27 22:48:50

【问题描述】：

我有一个包含数字的数据表（“规范”） - 至少在我所见的范围内 - 以下形式的标准化值：

当我执行时

k <- kmeans(norm,center=3)

我收到以下错误：

Error in do_one(nmeth) : NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 1)

你能帮帮我吗？谢谢！

【问题讨论】：

你检查过你的数据中是否有NaN/NA/Inf吗？您可以使用is.na() 和is.finite() 函数进行检查

是的，我的文件表中有很多NAs，但我认为这应该不是问题？！ is.finite() 返回很多 TRUEs，但也有一些 FALSEs。我该如何解决这个问题？

您必须从数据中删除 NA/Inf/NaN 值。有关详细信息，请参阅“缺失值插补”方法。一种简单的方法是用行/列平均值替换它们。

@UjjwalKumar 谢谢！

【参考方案1】：

kmeans 无法处理具有 NA 值的数据。

然后，均值和方差不再明确定义，您不再知道哪个中心最近。

【讨论】：

Kmeans 无法处理具有 NA、INF 和 CONTANTS 的数据。

【参考方案2】：

do_one(nmeth) 中的错误：外部函数调用中的 NA/NaN/Inf (arg 1)

由于表中存在非数值，也会发生此错误。

【参考方案3】：

所有遇到“do_one(nmeth) 中的错误：外部函数调用中的 NA/NaN/Inf (arg 1)”问题的所有人 而不是

results <- kmeans(iris.features,3)
results

写下以下内容，请注意 iris 中的大小写你在开始时使用的任何内容

results <- kmeans(na.omit(irisa.features),3) # this helps in omitting NA 
results

【参考方案4】：

关于错误说明：

do_one(nmeth) 中的错误：外部函数调用中的 NA/NaN/Inf (arg 1)

您在上面发布的数据集包含缩放条目，原因一定是您的数据集中有 NA 值，因此通过以下代码省略它们。

km_cluster <- kmeans(na.omit(MyData), 3)
km_cluster
km_cluster$withinss
km_cluster$tot.withinss/km_cluster$betweenss