从单个 jupyter/ipython 单元格绘制多个 python-igraph 图

Posted 2023-03-12

【中文标题】从单个 jupyter/ipython 单元格绘制多个 python-igraph 图

【英文标题】：Draw multiple python-igraph graphs from single jupyter/ipython cell

【发布时间】：2017-12-14 09:45:12

【问题描述】：

Similarly to this question，我想使用以下代码从单个 ipython-notebook 单元格中绘制多个图形：

[1]:
%matplotlib inline
import igraph # it is `pip install python-igraph` on py2
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

[2]:
# draws a graph successfully
igraph.plot(igraph.Graph.Erdos_Renyi(10, .5))

[3]:
for p in np.arange(.3, .8, .1):
    g = igraph.Graph.Erdos_Renyi(10, p)
    igraph.plot(g)

如何在笔记本上显示来自[3] 单元格的多个图表？

如果我想像这样绘制一些 matplotlib 图表，我似乎可以使用这个解决方案：

[4]:
for p in np.arange(.3, .8, .1):
    g = igraph.Graph.Erdos_Renyi(10, p)
    plt.loglog(sorted(g.degree(), reverse=True), marker='o')
    plt.show()

但这不适用于 igraph 图 AFAICS。有什么方法可以将igraph.drawing.Plot 转换为更熟悉的matplotlib 对象吗？

【参考方案1】：

我最终得到了这样的解决方案：

from IPython.core.display import display, SVG

for p in np.arange(.3, .8, .1):
    g = igraph.Graph.Erdos_Renyi(10, p)
    print(p)
    display(SVG(igraph.plot(g)._repr_svg_()))

同样可用于支持_repr_svg_() 或_repr_png_() 的任何对象，因此到目前为止这不受python-igraph 的限制。

【参考方案2】：

我正在使用 igraph 0.8.2 和 Python 3.7。上面的答案对我不起作用：

TypeError: a bytes-like object is required, not 'tuple'

我找到了另一种使用临时文件并从中读取图像的方法：

import os
from IPython.display import display, Image

for p in np.arange(.3, .8, .1):
    g = ig.Graph.Erdos_Renyi(10, p)
    ig.plot(g).save('temporary.png') 
    display(Image(filename='temporary.png'))
    os.remove('temporary.png')

【参考方案3】：

如果你在较新的 Python 上使用第一个答案，你会得到：

TypeError: a bytes-like object is required, not 'tuple'

但你只需要修改最后一行改为：

Display(SVG(igraph.plot(g)._repr_svg_()[0]))