Pandas - 在数据框中的列内扩展嵌套的 json 数组
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【中文标题】Pandas - 在数据框中的列内扩展嵌套的 json 数组【英文标题】:Pandas - expand nested json array within column in dataframe 【发布时间】:2018-05-25 16:52:27 【问题描述】:我有一个 json 数据(来自 mongodb),其中包含数千条记录(因此是一个 json 对象的数组/列表),每个对象的结构如下所示:
"id":1,
"first_name":"Mead",
"last_name":"Lantaph",
"email":"mlantaph0@opensource.org",
"gender":"Male",
"ip_address":"231.126.209.31",
"nested_array_to_expand":[
"property":"Quaxo",
"json_obj":
"prop1":"Chevrolet",
"prop2":"Mercy Streets"
,
"property":"Blogpad",
"json_obj":
"prop1":"Hyundai",
"prop2":"Flashback"
,
"property":"Yabox",
"json_obj":
"prop1":"Nissan",
"prop2":"Welcome Mr. Marshall (Bienvenido Mister Marshall)"
]
在数据帧中加载时,“nested_array_to_expand”是一个包含 json 的字符串(我在加载过程中确实使用了“json_normalize”)。预期的结果是获得一个包含 3 行的数据框(如上例所示)和嵌套对象的新列,如下所示:
index email first_name gender id ip_address last_name \
0 mlantaph0@opensource.org Mead Male 1 231.126.209.31 Lantaph
1 mlantaph0@opensource.org Mead Male 1 231.126.209.31 Lantaph
2 mlantaph0@opensource.org Mead Male 1 231.126.209.31 Lantaph
test.name test.obj.ahah test.obj.buzz
0 Quaxo Mercy Streets Chevrolet
1 Blogpad Flashback Hyundai
2 Yabox Welcome Mr. Marshall (Bienvenido Mister Marshall) Nissan
我能够使用以下函数获得该结果,但速度极慢(1k 条记录大约需要 2 秒),因此我想改进现有代码或找到一种完全不同的方法来获得此结果。
def expand_field(field, df, parent_id='id'):
all_sub = pd.DataFrame()
# we need an id per row to be able to merge back dataframes
# if no id, then we will create one based on index of rows
if parent_id not in df:
df[parent_id] = df.index
# go through all rows and create a new dataframe with values
for i, row in df.iterrows():
try:
sub = json_normalize(df[field].values[i])
sub = sub.add_prefix(field + '.')
sub['parent_id'] = row[parent_id]
all_sub = all_sub.append(sub)
except:
print('crash')
pass
df = pd.merge(df, all_sub, left_on=parent_id, right_on='parent_id', how='left')
#remove old columns
del df["parent_id"]
del df[field]
#return expanded dataframe
return df
非常感谢您的帮助。
===== 编辑回复评论 ====
从 mongodb 加载的数据是一个对象数组。 我用以下代码加载它:
data = json.loads(my_json_string)
df = json_normalize(data)
输出给我一个带有 df["nested_array_to_expand"] 作为 dtype 对象(字符串)的数据框
0 ['property': 'Quaxo', 'json_obj': 'prop1': '...
Name: nested_array_to_expand, dtype: object
【问题讨论】:
是dict或者json 感谢您查看。我编辑了这个问题,用示例和代码回答你。基本上我的 json 数据是一个对象数组,我加载然后用 json_normalize 规范化。那么“nest_array_to_expand”列就是一个 dtype 对象。pd.json_normalize(data_list, "nested_array_to_expand", ['email', 'first_name', 'gender', 'id', 'ip_address', 'last_name'])
其中,data_list
是字典列表。
【参考方案1】:
我提出了一个有趣的答案,我认为使用pandas.json_normalize
。
我用它来扩展嵌套的json
——也许有更好的方法,但你绝对应该考虑使用这个功能。然后,您只需根据需要重命名列。
import io
from pandas import json_normalize
# Loading the json string into a structure
json_dict = json.load(io.StringIO(json_str))
df = pd.concat([pd.DataFrame(json_dict),
json_normalize(json_dict['nested_array_to_expand'])],
axis=1).drop('nested_array_to_expand', 1)
【讨论】:
谢谢。我会检查我的设置:) 嗨 Romain,不幸的是,该代码在我的设置中不起作用,因为我从我的 json 中获得了一个字典列表,而不是直接一个字典。 我想通了,并在下面发布了一个解决方案。【参考方案2】:下面的代码就是你想要的。您可以使用 python 的内置列表函数展开嵌套列表并将其作为新数据框传递。
pd.DataFrame(list(json_dict['nested_col']))
您可能需要对此进行多次迭代,具体取决于数据的嵌套程度。
from pandas.io.json import json_normalize
df= pd.concat([pd.DataFrame(json_dict), pd.DataFrame(list(json_dict['nested_array_to_expand']))], axis=1).drop('nested_array_to_expand', 1)
【讨论】:
【参考方案3】:import pandas as pd
import json
data = '''
[
"id":1,
"first_name":"Mead",
"last_name":"Lantaph",
"email":"mlantaph0@opensource.org",
"gender":"Male",
"ip_address":"231.126.209.31",
"nested_array_to_expand":[
"property":"Quaxo",
"json_obj":
"prop1":"Chevrolet",
"prop2":"Mercy Streets"
,
"property":"Blogpad",
"json_obj":
"prop1":"Hyundai",
"prop2":"Flashback"
,
"property":"Yabox",
"json_obj":
"prop1":"Nissan",
"prop2":"Welcome Mr. Marshall (Bienvenido Mister Marshall)"
]
]
'''
data = json.loads(data)
result = pd.json_normalize(data, "nested_array_to_expand",
['email', 'first_name', 'gender', 'id', 'ip_address', 'last_name'])
结果
property json_obj.prop1 json_obj.prop2 \
0 Quaxo Chevrolet Mercy Streets
1 Blogpad Hyundai Flashback
2 Yabox Nissan Welcome Mr. Marshall (Bienvenido Mister Marshall)
email first_name gender id ip_address last_name
0 mlantaph0@opensource.org Mead Male 1 231.126.209.31 Lantaph
1 mlantaph0@opensource.org Mead Male 1 231.126.209.31 Lantaph
2 mlantaph0@opensource.org Mead Male 1 231.126.209.31 Lantaph
更多关于json_normalize
的信息:
https://pandas.pydata.org/docs/reference/api/pandas.json_normalize.html
【讨论】:
以上是关于Pandas - 在数据框中的列内扩展嵌套的 json 数组的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
如何在 Pandas 数据框中的特定位置插入一列? (更改熊猫数据框中的列顺序)
在计算 Pandas 创建的数据框中的列的平均值时指定“跳过 NA”