如何在 IPython 中运行 shell 命令？ （Python Profiling GUI 工具）

Posted 2023-03-06

【中文标题】如何在 IPython 中运行 shell 命令？ （Python Profiling GUI 工具）

【英文标题】：How to run shell-commands in IPython? (Python Profiling GUI tools)

【发布时间】：2015-06-20 08:42:32

【问题描述】：

我正在尝试在 IPython 中进行文件分析，生成一些分析统计输出，然后将其传递给一些 Python 分析 GUI 工具，例如 KCachegrind。这是我试图做到这一点的代码。所有代码都在 IPython 中执行。

# example function for profiling
def factorial(n):
    if n == 0:
        return 1.0
    else:
        return float(n) * factorial(n-1)

def taylor_sin(n):
    res = []
    for i in range(n):
        if i % 2 == 1:
           res.append((-1)**((i-1)/2)/float(factorial(i)))
        else:
           res.append(0.0)
    return res

# generate cProfile output (the stats, not the text)
%prun -D prof.out x = taylor_sin(500)

# do conversion using pyprof2calltree
# to do it in IPython, add prefix '!' to code to make it Shell-command code
!pyprof2calltree -i prof.out -o prof.calltree

现在 IPython 会打印一条错误消息：

!pyprof2calltree -i prof.out -o prof.calltree
/bin/sh: 1: pyprof2calltree: not found

这是说我没有将pyprof2calltree 添加到环境路径或类似的东西吗？如何解决？

我可以在纯 shell 命令中完美运行它。但我不喜欢在 IPython 和终端之间频繁切换，我只想在 IPython 中完成所有工作。我知道添加前缀 ! 会使代码像在 shell 命令中一样运行，但为什么它会向我提出如上所示的错误？

Jian@Home-PC:~/Dropbox/Coding/Python$ pyprof2calltree -i prof.out -o   prof.calltree
writing converted data to: prof.calltree
Jian@Home-PC:~/Dropbox/Coding/Python$

IPython 与 Anaconda py3.4 一起安装；操作系统 Ubuntu 14.04； pyprof2calltree 通过 pip 安装

【参考方案1】：

来自pyprof2calltree documentation 中的ipython 示例：

>>> from pyprof2calltree import convert, visualize
>>> visualize('prof.out')
>>> convert('prof.out', 'prof.calltree')

或者：

>>> results = %prun -r x = taylor_sin(500)
>>> visualize(results)
>>> convert(results, 'prof.calltree')

你也可以试试：

>>> %run -m pyprof2calltree -i prof.out -o prof.calltree