如何从线性模型 (lm) 预测 x 值
Posted
技术标签:
【中文标题】如何从线性模型 (lm) 预测 x 值【英文标题】:How to predict x values from a linear model (lm) 【发布时间】:2012-08-18 01:27:22 【问题描述】:我有这个数据集:
x <- c(0, 40, 80, 120, 160, 200)
y <- c(6.52, 5.10, 4.43, 3.99, 3.75, 3.60)
我使用lm()
计算了一个线性模型:
model <- lm(y ~ x)
如果我有新的y
值,我想知道x
的预测值,例如ynew <- c(5.5, 4.5, 3.5)
,但如果我使用 predict()
函数,它只会计算新的 y
值。
如果我有新的y
值,我如何预测新的x
值?
【问题讨论】:
【参考方案1】:如果您的关系是非单调的,或者如果您有多个预测变量值,那么给定 y 值可能有多个 x 值,您需要决定如何处理。
一个可能很慢的选项(可能是提到的其他包中使用的方法)是使用 uniroot 函数:
x <- runif(100, min=-1,max=2)
y <- exp(x) + rnorm(100,0,0.2)
fit <- lm( y ~ poly(x,3), x=TRUE )
(tmp <- uniroot( function(x) predict(fit, data.frame(x=x)) - 4, c(-1, 2) )$root)
library(TeachingDemos)
plot(x,y)
Predict.Plot(fit, 'x', data=data.frame(x=x), add=TRUE, ref.val=tmp)
您可以使用 TeachingDemos
包中的 TkPredict
函数来查看解决方案。
或者您可以通过生成大量预测点来获得相当快的近似值,然后将它们提供给 approxfun
或 splinfun
函数以生成近似值:
tmpx <- seq(min(x), max(x), length.out=250)
tmpy <- predict(fit, data.frame(x=tmpx) )
tmpfun <- splinefun( tmpy, tmpx )
tmpfun(4)
【讨论】:
【参考方案2】:由于这是化学中的一个典型问题(从校准中预测值),chemCal
包提供了inverse.predict
。但是,此功能仅限于“具有模型公式 y ~ x 或 y ~ x - 1 的 lm 或 rlm 类的单变量模型对象[s]。”
x <- c(0, 40, 80, 120, 160, 200)
y <- c(6.52, 5.10, 4.43, 3.99, 3.75, 3.60)
plot(x,y)
model <- lm(y ~ x)
abline(model)
require(chemCal)
ynew <- c(5.5, 4.5, 3.5)
xpred<-t(sapply(ynew,function(y) inverse.predict(model,y)[1:2]))
# Prediction Standard Error
#[1,] 31.43007 -38.97289
#[2,] 104.7669 -36.45131
#[3,] 178.1037 -39.69539
points(xpred[,1],ynew,col="red")
警告:这个函数很慢,不适合,如果你需要反演。预测大量的值。
如果我没记错的话,neg.发生 SE 是因为函数期望斜率始终为正。 SE的绝对值应该仍然是正确的。
【讨论】:
对于它的价值,library(sos); findFn("inverse prediction")
找到了这个函数,以及 quantchem
包中的一个类似函数(它似乎也做非线性反演......)【参考方案3】:
我认为你只需要使用代数将y=a+b*x
反转为x=(y-a)/b
:
cc <- coef(model)
(xnew <- (ynew-cc[1])/cc[2])
# [1] 31.43007 104.76689 178.10372
plot(x,y
abline(model)
points(xnew,ynew,col=2)
在这里查看您的“数据”,我认为非线性回归可能会更好......
【讨论】:
我知道我可以用代数解决这个问题,但我认为这可以用一些 R 函数来解决。我会用非线性回归来实现吗?谢谢。以上是关于如何从线性模型 (lm) 预测 x 值的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
R语言使用lm构建线性回归模型并将目标变量对数化实战:可视化模型预测输出与实际值对比图可视化模型的残差模型系数(coefficient)模型总结信息(summary)残差总结信息