常用的外部排序方法
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了常用的外部排序方法相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
定义问题
外部排序指的是大文件的排序,即待排序的记录存储在外存储器上,待排序的文件无法一次装入内存,需要在内存和外部存储器之间进行多次数据交换,以达到排序整个文件的目的。外部排序最常用的算法是多路归并排序,即将原文件分解成多个能够一次性装入内存的部分,分别把每一部分调入内存完成排序。然后,对已经排序的子文件进行多路归并排序。
处理过程
(1)按可用内存的大小,把外存上含有n个记录的文件分成若干个长度为L的子文件,把这些子文件依次读入内存,并利用有效的内部排序方法对它们进行排序,再将排序后得到的有序子文件重新写入外存;
(2)对这些有序子文件逐趟归并,使其逐渐由小到大,直至得到整个有序文件为止。
先从一个例子来看外排序中的归并是如何进行的?
假设有一个含10000 个记录的文件,首先通过10 次内部排序得到10 个初始归并段R1~R10 ,其中每一段都含1000 个记录。然后对它们作如图10.11 所示的两两归并,直至得到一个有序文件为止 如下图
多路归并排序算法以及败者树
多路归并排序算法在常见数据结构书中都有涉及。从2路到多路(k路),增大k可以减少外存信息读写时间,但k个归并段中选取最小的记录需要比较k-1次,为得到u个记录的一个有序段共需要(u-1)(k-1)次,若归并趟数为s次,那么对n个记录的文件进行外排时,内部归并过程中进行的总的比较次数为s(n-1)(k-1),也即(向上取整)(logkm)(k-1)(n-1)=(向上取整)(log2m/log2k)(k-1)(n-1),而(k-1)/log2k随k增而增因此内部归并时间随k增长而增长了,抵消了外存读写减少的时间,这样做不行,由此引出了“败者树”tree of loser的使用。在内部归并过程中利用败者树将k个归并段中选取最小记录比较的次数降为(向上取整)(log2k)次使总比较次数为(向上取整)(log2m)(n-1),与k无关。
败者树是完全二叉树,因此数据结构可以采用一维数组。其元素个数为k个叶子结点、k-1个比较结点、1个冠军结点共2k个。ls[0]为冠军结点,ls[1]--ls[k-1]为比较结点,ls[k]--ls[2k-1]为叶子结点(同时用另外一个指针索引b[0]--b[k-1]指向)。另外bk为一个附加的辅助空间,不属于败者树,初始化时存着MINKEY的值。
多路归并排序算法的过程大致为:
1):首先将k个归并段中的首元素关键字依次存入b[0]--b[k-1]的叶子结点空间里,然后调用CreateLoserTree创建败者树,创建完毕之后最小的关键字下标(即所在归并段的序号)便被存入ls[0]中。然后不断循环:
2)把ls[0]所存最小关键字来自于哪个归并段的序号得到为q,将该归并段的首元素输出到有序归并段里,然后把下一个元素关键字放入上一个元素本来所在的叶子结点b[q]中,调用Adjust顺着b[q]这个叶子结点往上调整败者树直到新的最小的关键字被选出来,其下标同样存在ls[0]中。循环这个操作过程直至所有元素被写到有序归并段里。
四、伪代码:
void Adjust(LoserTree &ls, int s)
/*从叶子结点b[s]到根结点的父结点ls[0]调整败者树*/
int t, temp;
t=(s+K)/2; /*t为b[s]的父结点在败者树中的下标,K是归并段的个数*/
while(t>0) /*若没有到达树根,则继续*/
if(b[s]>b[ls[t]]) /*与父结点指示的数据进行比较*/
/*ls[t]记录败者所在的段号,s指示新的胜者,胜者将去参加更上一层的比较*/
temp=s;
s=ls[t];
ls[t]=temp;
t=t/2; /*向树根退一层,找到父结点*/
ls[0]=s; /*ls[0]记录本趟最小关键字所在的段号*/
void K_merge( int ls[K])
/*ls[0]~ls[k-1]是败者树的内部比较结点。b[0]~b[k-1]分别存储k个初始归并段的当前记录*/
/*函数Get_next(i)用于从第i个归并段读取并返回当前记录*/
int b[K+1),i,q;
for(i=0; i<K;i++)
b[i]=Get_next(i); /*分别读取K个归并段的第一个关键字*/
b[K]=MINKEY; /*创建败者树*/
for(i=0; i<K ; i++) /*设置ls中的败者初值*/
ls[i]=K;
for(i=K-1 ; i>=0 ; i--) /*依次从b[K-1]……b[0]出发调整败者*/
Adjust(ls , i); /*败者树创建完毕,最小关键字序号存入ls[0]
while(b[ls[0]] !=MAXKEY )
q=ls[0]; /*q为当前最小关键字所在的归并段*/
prinftf("%d",b[q]);
b[q]=Get_next(q);
Adjust(ls,q); /*q为调整败者树后,选择新的最小关键字*/
如下图,一个详细的过程。2个子结点比较后的败者放入它们的父结点,而胜者送到它们父结点的父节点去再作比较,这才是败者树。b[0]放的是最终的胜者。
胜者树与败者树
胜者树和败者树都是完全二叉树,是树形选择排序的一种变型。每个叶子结点相当于一个选手,每个中间结点相当于一场比赛,每一层相当于一轮比赛。
不同的是,胜者树的中间结点记录的是胜者的标号;而败者树的中间结点记录的败者的标号。
胜者树与败者树可以在log(n)的时间内找到最值。任何一个叶子结点的值改变后,利用中间结点的信息,还是能够快速地找到最值。在k路归并排序中经常用到。
胜者树
胜者树的一个优点是,如果一个选手的值改变了,可以很容易地修改这棵胜者树。只需要沿着从该结点到根结点的路径修改这棵二叉树,而不必改变其他比赛的结果。
Fig. 1
Fig.1是一个胜者树的示例。规定数值小者胜。
1. b3 PK b4,b3胜b4负,内部结点ls[4]的值为3;
2. b3 PK b0,b3胜b0负,内部结点ls[2]的值为3;
3. b1 PK b2,b1胜b2负,内部结点ls[3]的值为1;
4. b3 PK b1,b3胜b1负,内部结点ls[1]的值为3。.
当Fig. 1中叶子结点b3的值变为11时,重构的胜者树如Fig. 2所示。
1. b3 PK b4,b3胜b4负,内部结点ls[4]的值为3;
2. b3 PK b0,b0胜b3负,内部结点ls[2]的值为0;
3. b1 PK b2,b1胜b2负,内部结点ls[3]的值为1;
4. b0 PK b1,b1胜b0负,内部结点ls[1]的值为1。.
Fig. 2
败者树
败者树是胜者树的一种变体。在败者树中,用父结点记录其左右子结点进行比赛的败者,而让胜者参加下一轮的比赛。败者树的根结点记录的是败者,需要加一个结点来记录整个比赛的胜利者。采用败者树可以简化重构的过程。
Fig. 3
Fig. 3是一棵败者树。规定数大者败。
1. b3 PK b4,b3胜b4负,内部结点ls[4]的值为4;
2. b3 PK b0,b3胜b0负,内部结点ls[2]的值为0;
3. b1 PK b2,b1胜b2负,内部结点ls[3]的值为2;
4. b3 PK b1,b3胜b1负,内部结点ls[1]的值为1;
5. 在根结点ls[1]上又加了一个结点ls[0]=3,记录的最后的胜者。
败者树重构过程如下:
· 将新进入选择树的结点与其父结点进行比赛:将败者存放在父结点中;而胜者再与上一级的父结点比较。
· 比赛沿着到根结点的路径不断进行,直到ls[1]处。把败者存放在结点ls[1]中,胜者存放在ls[0]中。
Fig. 4
Fig. 4是当b3变为13时,败者树的重构图。
注意,败者树的重构跟胜者树是不一样的,败者树的重构只需要与其父结点比较。对照Fig. 3来看,b3与结点ls[4]的原值比较,ls[4]中存放的原值是结点4,即b3与b4比较,b3负b4胜,则修改ls[4]的值为结点3。同理,以此类推,沿着根结点不断比赛,直至结束。
由上可知,败者树简化了重构。败者树的重构只是与该结点的父结点的记录有关,而胜者树的重构还与该结点的兄弟结点有关。
败者树 多路平衡归并外部排序
外部排序的基本思路
假设有一个72KB的文件,其中存储了18K个整数,磁盘中物理块的大小为4KB,将文件分成18组,每组刚好4KB。
首先通过18次内部排序,把18组数据排好序,得到初始的18个归并段R1~R18,每个归并段有1024个整数。
然后对这18个归并段使用4路平衡归并排序:
第1次归并:产生5个归并段
R11 R12 R13 R14 R15
其中
R11是由R1,R2,R3,R4中的数据合并而来
R12是由R5,R6,R7,R8中的数据合并而来
R13是由R9,R10,R11,R12中的数据合并而来
R14是由R13,R14,R15,R16中的数据合并而来
R15是由R17,R18中的数据合并而来
把这5个归并段的数据写入5个文件:
foo_1.dat foo_2.dat foo_3.dat foo_4.dat foo_5.dat
第2次归并:从第1次归并产生的5个文件中读取数据,合并,产生2个归并段
R21 R22
其中R21是由R11,R12,R13,R14中的数据合并而来
其中R22是由R15中的数据合并而来
把这2个归并段写入2个文件
bar_1.dat bar_2.dat
第3次归并:从第2次归并产生的2个文件中读取数据,合并,产生1个归并段
R31
R31是由R21,R22中的数据合并而来
把这个文件写入1个文件
foo_1.dat
此即为最终排序好的文件。
使用败者树加快合并排序
外部排序最耗时间的操作时磁盘读写,对于有m个初始归并段,k路平衡的归并排序,磁盘读写次数为
|logkm|,可见增大k的值可以减少磁盘读写的次数,但增大k的值也会带来负面效应,即进行k路合并
的时候会增加算法复杂度,来看一个例子。
把n个整数分成k组,每组整数都已排序好,现在要把k组数据合并成1组排好序的整数,求算法复杂度
u1: xxxxxxxx
u2: xxxxxxxx
u3: xxxxxxxx
.......
uk: xxxxxxxx
算法的步骤是:每次从k个组中的首元素中选一个最小的数,加入到新组,这样每次都要比较k-1次,故
算法复杂度为O((n-1)*(k-1)),而如果使用败者树,可以在O(logk)的复杂度下得到最小的数,算法复杂
度将为O((n-1)*logk), 对于外部排序这种数据量超大的排序来说,这是一个不小的提高。
关于败者树的创建和调整,可以参考清华大学《数据结构-C语言版》
产生二进制测试数据
打开Linux终端,输入命令
dd if=/dev/urandom of=random.dat bs=1M count=512
这样在当前目录下产生一个512M大的二进制文件,文件内的数据是随机的,读取文件,每4个字节
看成1个整数,相当于得到128M个随机整数。
程序实现
[cpp] view plain copy
- #include <assert.h>
- #include <fcntl.h>
- #include <stdio.h>
- #include <stdlib.h>
- #include <string.h>
- #include <unistd.h>
- #include <sys/time.h>
- #include <sys/types.h>
- #include <sys/stat.h>
- #define MAX_INT ~(1<<31)
- #define MIN_INT 1<<31
- //#define DEBUG
- #ifdef DEBUG
- #define debug(...) debug( __VA_ARGS__)
- #else
- #define debug(...)
- #endif
- #define MAX_WAYS 100
- typedef struct run_t
- int *buf; /* 输入缓冲区 */
- int length; /* 缓冲区当前有多少个数 */
- int offset; /* 缓冲区读到了文件的哪个位置 */
- int idx; /* 缓冲区的指针 */
- run_t;
- static unsigned int K; /* K路合并 */
- static unsigned int BUF_PAGES; /* 缓冲区有多少个page */
- 外部排序归并排序 败者树