R语言-均值填充缺失值

Posted 2023-05-01

参考技术A 在基因芯片数据或其他类型数据中，采用计算所有样本的平均值从而进行填充，如果需要用中位数或其他统计量填充时只需修改相应的方法即可

#1. 检查是否有缺失值

which(is.na(mRNA),arr.ind = T)

#2. 计算行均值并填充

#该数据中探针（基因）为行（名），样本为列（名），（数据框内容为表达量数据值型数据数据）格式可见文章最后

row_mean <- apply(mRNA,1,mean,na.rm =T) #1是行，2是列，若用其他方法修改mean即可

mRNA$MEAN <- row_mean

ncol = 样本数

for (i in 1:nrow(mRNA))

  mRNA[i,is.na(mRNA[i,])] <- mRNA[i,ncol]

R语言进行缺失值填充（Filling in missing values）：使用R原生方法data.tabledplyr等方案

R语言进行缺失值填充（Filling in missing values）：使用R原生方法、data.table、dplyr等方案

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