生信实验记录(part1)--为Jupyter指定虚拟环境的Python解释器

Posted 2022-07-11 GoatGui

学习笔记，仅供参考，有错必纠

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为Jupyter指定虚拟环境的Python解释器

引言

上周开始做生信实验，为了不干扰到电脑原来的环境，就整了个虚拟环境（具体虚拟环境的创建流程请见​​Django从理论到实战(part1)–虚拟环境​​​），配置好实验环境后，不知道怎么在Jupyter Notebook中指定虚拟环境的python解释器，查找资料后（​​为 Jupyter Notebook指定虚拟环境的 Python 解释器​​），解决疑问，写下此篇.

实现步骤

首先，开启我的虚拟环境：

在虚拟环境stagate_env中安装​​ipykernel​​库：

pip install ipykernel

如果下载某个包，非常慢，甚至慢到报错，可以使用镜像下载，比如我经常使用清华镜像：

pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple ipykernel

向 jupyter 中添加虚拟环境，命名为python37：

python -m ipykernel install --python37

打开jupyter notebook，可以看到​​New​​下拉菜单中，多了python37.

创建好后，我们就可以开始跑实验了.